Voici quelques éléments que vous pouvez essayer :

Connectez-vous à iCloud.com et vérifiez quelles notes y sont présentes. Cela vous donne une bonne idée de l'appareil qui est correctement connecté au Cloud.

Les appareils qui se synchronisent sur cette base peuvent être mis de côté.

Sur les appareils qui ne le sont pas, vérifiez d'abord que les Notes iCloud sont activées. Ensuite, ouvrez Notes et vérifiez l'emplacement des notes. Les notes doivent être conservées dans "iCloud", et non dans le compte local "Sur mon iPhone", ou dans le compte de l'un de vos fournisseurs de messagerie.

Si vous avez vérifié que les Notes iCloud sont activées et que les notes sont dans le compte iCloud, vous pouvez essayer de désactiver puis d'activer les Notes. Si vous avez des notes plus récentes qui n'ont pas encore été synchronisées avec iCloud, je vous recommande de les déplacer vers votre compte "Sur mon iPhone" avant de faire cela (vous devrez peut-être activer le compte dans les réglages de Notes).

Utiliser un navigateur web ou créer une fausse application Notes avec Fluid

Si vous travaillez sur une version de Mac inférieure à 10.10 (ou pire encore, inférieure à 10.9), votre application Notes intégrée ne se synchronise pas avec votre compte iCloud (même si vous avez sélectionné cette option dans les Préférences Système --> iCloud).

Vous pouvez, bien entendu, utiliser un navigateur web pour modifier vos notes dans iCloud.
Cependant, je recommande d'utiliser Fluide pour créer une fausse application Notes.
En fait, j'ai tellement apprécié cette méthode que j'ai également créé une application Fluid pour les rappels.

Procédure :

1. Télécharger ici la dernière version de Fluid compatible avec 10.11.
2. Installez comme d'habitude et lancez l'application.
3. Dans le champ URL, introduisez ceci : https://icloud.com/#notes2
4. Dans le champ Nom, introduisez, par exemple, "Notes (Fluid)".
5. Créez l'application.

Facultatif mais pratique

6. Lancez l'application "Notes (Fluid)" et ouvrez ses préférences.
7. Sous "Général", changez l'icône de l'application : recherchez une image, ou mieux, sélectionnez l'application Notes intégrée.
8. Sous "Comportement", assurez-vous que l'option "ne cache que les fenêtres" est sélectionnée.

PS :
Vous pouvez utiliser cette application Fluid comme un navigateur ; ainsi, vous pouvez créer de nouveaux onglets pour gérer des notes différentes dans la même fenêtre.