À chaque démarrage, OSX 10.8 vérifie toujours la présence de certaines applications dans le dock (Launchpad, Appstore, Reminders, Notes, etc.) et les réintroduit dans le dock si elles ont été supprimées. (Je ne sais pas pourquoi - cela me semble étrange et ennuyeux aussi).
La solution consiste à modifier le fichier plist du système (/Library/Preferences/com.apple.dockfixup.plist), en supprimant les éléments de configuration qui définissent ces "fixups". Pour modifier ce fichier, vous aurez besoin des privilèges d'administrateur - TextWrangler devrait vous y inviter automatiquement, lorsque vous commencerez à modifier les choses.
Dans le fichier plist, trouvez la clé "add-app", qui doit être suivie immédiatement d'un élément, qui contient plusieurs éléments :
<key>add-app</key>
<array>
<dict>
...
</dict>
<dict>
...
</dict>
...
</array>
Vous pouvez supprimer de manière sélective uniquement les éléments de certaines applications, ou les supprimer tous.
Après avoir enregistré ces modifications, vous devrez toujours supprimer manuellement les icônes de dock en question. Cependant, lors des prochains redémarrages, le système ne réintroduira pas automatiquement ces applications dans le dock. (Vous pourrez toujours les réintroduire manuellement, si vous le souhaitez).