Je vérifierais que les deux lecteurs sont sauvegardés, puis j'installerais le système d'exploitation avec votre configuration normale intacte et tous les lecteurs connectés. Cela permet aux scripts de voir toutes vos applications et, dans le cas où vous stockez des photos ou d'autres fichiers système / utilisateur sur les autres lecteurs, toutes les étapes de migration peuvent s'exécuter sur ces données.
Toutes les installations Apple sont désormais des archives et des mises à niveau où l'installateur exécute des vérifications pré-installation, des scripts pré-installation, crée un nouveau système, puis exécute des scripts de migration et de nettoyage post-installation pour déplacer tous vos paramètres vers le nouveau système.
La conversion APFS est uniquement pour les lecteurs système de démarrage SSD exclusifs et rien d'autre ne se convertit automatiquement pour la version 10.13.0. Les disques Fusion et les disques durs restent en HFS+ pour les premières versions de High Sierra de l'automne 2017.
Si vous n'êtes pas sûr d'être prêt pour cette installation complète, envisagez d'installer sur un lecteur externe et de faire des tests.