C'est peut-être un mauvais disque. J'ai exactement le même problème, le système est extrêmement lent après la restauration de Time Machine, tous les paramètres vitaux sont corrects, mais j'utilise un iMac de 2015. Il semble que ce soit un problème assez spécifique. Il est important de noter qu'il s'agit d'un volume APFS, car cela semble être assez courant. J'ai effectué la mise à niveau vers Mojave il y a environ 3 mois.
J'ai ouvert la console, et j'ai vu que des erreurs de btree invalides se produisaient constamment lorsque les fichiers essayaient d'être accédés, je suppose que c'est la cause de la lenteur. Disk Utility a trouvé des erreurs mais n'a pas pu les réparer, le démarrage en mode utilisateur unique en utilisant fsck n'a pas pu les réparer.
J'ai décidé d'effacer le volume et de réinstaller l'OS. 2 minutes avant de terminer la première étape de l'installation, une erreur est apparue disant qu'il y avait un problème avec l'installation, et de "réessayer". C'était une preuve suffisante pour me dire que ce disque physique est mauvais.
Une dernière chose à noter à ce sujet, mon disque Time Machine (disque externe WD de 3 To) sont tombés en panne au même moment ne peut être réparé, n'apparaît pas lors d'une restauration à partir d'une sauvegarde. Je ne sais pas trop quoi en penser, car c'est évidemment une coïncidence.
