Vous pourriez essayer de réaliser cette fonctionnalité avec une application comme "Afloat", comme vous l'avez déjà mentionné. Mais il semble qu'elle ne fonctionne dans El Capitan que si vous désactivez en permanence la protection de l'intégrité du système (SIP), ce qui n'est pas recommandé.
Cependant, voici le lien vers le programme : https://github.com/millenomi/afloat
Comment désactiver le SIP : https://github.com/millenomi/afloat/issues/22
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Envisager de remplacer El Capitan par MacOS afin d'élargir le spectre de la question.
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MacOS ne fait référence qu'à Sierra et aux versions ultérieures, pas à El Capitan et aux versions antérieures. Si vous regardez sur les sites d'Apple, ils utilisent OS X pour El Cap et les versions antérieures. Pour cette question, le titre devrait rester "El Capitan" car c'est ce à quoi le PO fait référence.