La restauration à partir de Time Machine restaure-t-elle également les applications installées ?

Oui - si vous n'avez pas exclu le /Applications des sauvegardes Time Machine.

En ce qui concerne les correctifs du système, vous installez un nouveau système d'exploitation. Une fois l'installation terminée, lancez la mise à jour du logiciel et vous obtiendrez la dernière mise à jour Combo. En fait, il est préférable d'utiliser la mise à jour combinée plutôt qu'une collection de correctifs que vous auriez autrement.

Pour en savoir plus, consultez le site Préférences système → Time Machine → Options . Il vous indiquera ce que vous avez exclu, le cas échéant.

Non. Tant que vous disposez de suffisamment d'espace, tout ira bien. Il n'est pas nécessaire que le disque soit identique.