Growly Notes est totalement gratuit (et très proche du look de OneNote) http://www.growlybird.com/GrowlyBird/Notes.html
Cependant, rien n'est aussi bon que OneNote (si c'est ce que vous aimez). Vous pouvez installer OneNote 2007 sur OSX en utilisant crossover (essentiellement 'wine'). Cela ne fonctionne pas avec OneNote 2010, seulement 2007. Il démarre rapidement et fonctionne parfaitement. Le seul problème que je vois est que le lien direct fait planter OneNote. Si vous essayez d'installer, recherchez la configuration personnalisée de OneNote 2007 dans crossover, si lors de l'installation il se plaint des polices etc... continuez simplement l'installation et ignorez tout problème. OneNote 2007 fonctionnera très bien sous OSX 10.6 http://www.codeweavers.com/products/impersonator/
Si vous recherchez quelque chose d'un peu différent, mais tout aussi addictif à utiliser que OneNote, je recommanderais d'essayer un programme appelé Scrivener. C'est l'un des rares programmes que j'ai trouvé parfait pour écrire et organiser mes pensées. http://www.literatureandlatte.com/scrivener.php
Vous avez mentionné freemind (cartes mentales), je recommanderais totalement un programme appelé Vue, c'est aussi gratuit, très élégant, et pas aussi linéaire que freemind, permet également d'ajouter des notes, des mots-clés, des calques etc... pour organiser vos données. http://vue.tufts.edu/
J'ai utilisé toutes les autres applications suggérées (evernote, yojimbo, etc...) Je les aime bien et les utilise. Mais j'espère avoir mis en lumière quelques applications très utiles/agréables que la plupart des gens ne connaissent pas.